2 依赖及安装步骤

2.1 硬件要求

  • GTX.CAT™目前只可运行在Linux系统中,我们推荐以下Linux发行版本:CentOS 7或者Ubuntu 16.04。

注解

GTX.CAT™软件未在其他Linux发行版测试,可能无法正常工作

  • GTX.CAT™软件运行需要至少64GB内存,尽管我们推荐使用128GB内存。比对步骤是最耗费内存的步骤。

  • GTX.CAT™软件需要至少500GB的高速读写SSD盘才能发挥软件的最大性能。我们建议该存储盘只存储临时文件,将最终分析结果和重要文件保存它处。

重要

v2.0.0版本之前,SSD硬盘的挂载点必须为 /ssd-cache

  • GTX.CAT™软件在36核72线程并配备AVX512指令集加速的x86-64处理器达到峰值性能。

注解

GTX.CAT™未在ARM架构机器上测试,可能无法正常工作

2.2 安装

您需按照如下指令,将GTX.CAT™安装在Linux系统的机器上:

  1. 获取软件发行包。软件发行包的名称为 GTX.CAT-xx.xx.xx.run

  2. 从Genetalks®公司获取软件授权。

  3. 将软件发行包和授权文件上传至需要安装的服务器。

  4. 用如下命令运行软件安装包,根据命令行提示完成安装:

    sh GTX.CAT-xx.xx.xx.run
    

注解

安装GTX.CAT™软件需要 sudo 权限,如果您没有 sudo 权限,请联系您的系统管理员。